內陸航道、港口及大型疏浚工程項目眾多，并形成了相應的施工工藝和機械設備。河道清淤公司針對圍網治理過程中污水底泥的污染物去除問題，探討了較多的“環保清淤”工程，即通過清理河湖底泥中的污染物，將河湖排出湖河的工程。環保清淤與工程化清淤的區別在于清淤底泥非常薄，大多數環保清淤底泥都是在20cm到40cm之間。所以，河道疏浚公司對設備定位、操作系統的要求很高。
富營養化河流正在清除富營養化的氮、磷營養物，實施大規模的環境保護清淤工程。為了提高城鄉河道水質，開展了河道疏浚工作。城鄉河道環保清淤工程與湖泊相比，可稍顯宏大，由于河道自身的流動性和互換性，施工精度和二次污染要求都不高。目前環保清淤工程在處理淤泥時采用了堆場堆積的方式，排出的淤泥首先儲存在堆場，將來在淤泥中進行土地恢復也許可以用來處理淤泥。
挖掘工程的主要目的是挖掘港池，清除淤泥，改善河流和湖泊的水環境，恢復生態環境，例如碼頭、港口和臨港工業區、沿海城市用地和休閑娛樂用地、岸灘維護、水利防洪和水庫清淤、改善河流和湖海的水環境，以及修建和填埋各種溝渠等。這對人類社會的進步，環境的改善，經濟的發展都有著重大的意義。
在過去的二十多年里，人類對環境標準的要求越來越高，預防和減少疏浚活動對水域和陸地的污染已經成為疏浚工程中必須考慮的問題，而利用疏浚方法挖掘水下污染土壤，進行工程處理，也是疏浚工程中的一個重要內容。
中小河流工程量較小，這些前期工作很容易被忽視，而實際上，專業河道清淤先做一些前期工作就可以順利實施，并且能夠發揮預期的作用，對整個工程有很大的幫助。在前期工作的基礎上，根據淤積量、大小、底泥性質和周圍條件，確定主要工程環節的清淤、運沙、處理淤泥和尾水等技能方案，選擇合適的清淤技能和施工設備，妥善處理處置淤泥，避免二次污染。近幾年來，由于港口、航道、內河、湖泊的清淤工程眾多，疏浚、清淤技術有了很大發展，裝備水平有了很大提高，但能通到中小河流的專用船舶和設備還不多。
